Phân tích cấu trúc và khai thác dữ liệu biểu hiện của họ gene mã hóa nhân tố phiên mã TCP ở cây bưởi (citrus grandis)

Kết quà khai thác dữ liệu biếu hiện phiên mà của họ gene mả hóa TCP ở bưởi Để xem xét chức năng cua TF TCP ở bười, các gene CgTCP được đôì chiếu trình tự tương đồng trên hệ tham chiếu của cam ngọt (C. sinensis) (Xu & cs., 2013), từ đó đấnh giá biểu hiện của gene CgTCP thông qua khai thác dữ liệu hệ phiên mả cúa cam ngọt tương ứng. Trong đó, mức độ biểu hiện của CgTCP ỏ bưởi được đánh giá gián tiếp thông qua dữ liệu phiên mả của các trình tự tương đồng ỏ cam ngọt tại 4 cơ quan, callus, hoa, lá và quá (Xu & cs., 2013). Kết quà cho thấy thông qua mức độ phiên mả cua các gene tương đồng trên c. sinensis. phần lớn các gene tương đồng vói CgTCP đểu có biểu hiện yếu tại callus, ngoại trừ Cs7glll20 (tương đồng với CgTCP12) và orange 1.U02427 (tương đồng với CgTCP2ỉ) được tăng cường biểu hiện tại callus (Hình 4). Trong khi đó, đả xác định Cs2gl5820 (tương đồng với CgTCP02) là gene có biểu hiện mạnh nhất, được tăng cường phiên mả ờ 3 cơ quan, lá, hoa và quả (Hình 4). Một gene khác là Cs7g25460 (tương đồng vói CgTCP06) cùng có biểu hiện mạnh ở lá và hoa, trong khi 2 gene, Cs5gl0130 (tương đồng vói CgTCPOỮ) & cs 7g03980 (tương đồng với CgTCPl 1) có mức phiên mà tảng ỏ lá (Hình 4). Việc khai thác dữ liệu biểu hiện của các gene tương đồng ỏ c. sinensis (loài họ hàng gần gùi vói c. grandis) đã chì ra rằng họ CgTCP có thế đóng vai trò quan trọng tại các 4 mẫu mô này. Các nghiên cứu trước đây đã chì ra rằng họ TCP có tham gia vào quá trình phân cành, phát triển ờ lá và ờ hoa (Francis & cs., 2016; Martín-Trillo & Cubas, 2010), đặc biệt là liên quan đến cơ chê đáp ứng bất lợi (Tran & cs., 2018). Cụ thể, dựa trên việc khai thác dữ liệu biểu hiện đả biết, các gene CaTCP được dự đoán có biểu hiện mạnh ờ lá và rễ cây đậu gà (Tran & cs., 2018). Kiểm chứng bằng kỳ thuật qRT-PCR cho thấy các gene CaTCPcó đáp ứng mạnh ờ mẫu lá và rễ xừ lý hạn (Tran & cs., 2018). Những ghi nhận này đểu phù hdp với già thuyết về chức nàng của họ gene CgTCP dựa trên khà nàng biểu hiện mạnh tại callus, lá, hoa và quà của các gene tương đồng trên c. sinensis.