Sự hiện diện của porcine parvovirus 1 (ppv1) ở lợn nuôi tại hà nội và vùng phụ cận

Trong khi đó đoạn gen được nhân lên trong phản ứng PCR phát hiện virus nằm trong vùng có mức tương đồng thấp kể trên. Do vậy, sản phẩm PCR phát hiện PPV1 được dùng giải mà phân đoạn gen NS1 của 10 mẫu dương tính PPV1 (Bảng 1). Hình 4 trình bày kết quả giải mã gen của 10 chủng PPV1. Kết quá ỏ hình 4 cho thấy 10 chúng PPV1 thực địa ở Việt Nam có trình tự phân đoạn gen NS1 ít thay đổi, với mức tương đồng rất cao từ 99,7% đến 100%. ở phân đoạn gen NS1 dài 263 nucleotide (nghiên cứu này), chỉ có 1 vị trí đa hình nucleotide là 1694 G-T (Hình 4B). So với 4 chủng tham chiếu (Kresse, 27a, Challenge và NADL-2), 10 chủng của Việt Nam có mức tương đồng trình tự nucleotide tốì thiểu là 98,8%. Đặc tính tương đồng cao vế trình tự nucleotide là do gen mà hóa NS1 có tính bảo thú cao hơn, tốc độ biến đổi thấp hơn so với gen mã hóa capsid protein (Ren & cs., 2013; Meszaros & cs., 2017). Theo danh mục thuốc thú y đã được cấp phép lưu hành tại Việt Nam (Cục Thú y, 2019), chỉ có vacxin vô hoạt phòng bệnh do PPV1 gây ra lưu hành trôn thị trường Việt Nam. Do vậy, kết quả PCR và giải trình tự gen khẳng định sự lưu hành cúa virus chủng thực địa ở lợn tại một sô' tỉnh miến Bắc. Cùng với kết quả công bố gần đây vế sự lưu hành các genotype parvovirus ở lợn nuôi tại miến Trung (Nguyen Tran Trung & cs., 2019) cho thấy PPV1 có mặt ở nhiều tỉnh/thành phố trong cả nước. Nghiên cứu này tiếp tục xác định mối quan hệ di truyền giữa các chủng PPV1 thực địa bằng phương pháp phân tích cây phát sinh chủng loại (Hình 5).