Sự lưu hành của porcine cytomegalovirus gây viêm mũi thể vùi ở các trại lợn phía Bắc Việt Nam

Kết quả so sánh trình tự axit amin gen DPOL cho thấy chủng PCMV2.TB.2018 sai khác ờ 01 vị trí axit amin thứ 24 (S«-*L) so với 2 chủng PCMV1.HN.2018 và PCMV.HN.2019. Tỉ lệ tương đổng về axit amin cùa chủng này so với 2 chủng còn lại đạt 99.17% (Hình 3). So sánh trình tự axit amin của các chủng PCMV nghiên cửu với các chùng tham chiếu được th|u thập trên ngân hàng gen thấy mức độ tương đồng axit amin từ 97,49-100% (Bảng 3). Trong đó, tương đồng cao với chủng Hn0601 và chủng FJ01 cùa Trung Quốc (mã số ngán hàng gen lần lượt HQ686081, MG696113) và chủng 55b của Tây Ban Nha (AF268040) tĩ lệ tương đồng từ 99.17-100%. Tỉ lệ tương đồng thấp hơn với chùng của B6 của Anh (AF268039) và chủng OF-1 cùa Nhật Bản (AF268041) ti lệ tương đồng từ 97,49-99.17%. Kết quả phân tích nguồn gốc phát sinh dựa trên cây phát sinh loài cùa các chủng PCMV nghiên cứu được thể hiện qua hình 4. Từ kết quả phân tích nguồn gốc phát sinh loài dựa trên trình tự nuclecotide gene DPOL cho thấy: 03 chùng PCMV nghiên cứu nằm trong 2 nhánh phát sinh khác nhau. Chủng PCMV1.HN.2018 và PCMV3.HN.2019 năm cùng nhánh phát sinh vói chủng Hn0601đưỢc phân lập ở Trung Quốc (mã sô ngân hàng gen HQ686081), chủng 489 của Đức (AF268042), chùng OF-1 của Nhật Bản (AF268041) và chủng 55b của Tây Ban Nha (AF268040). Trong khi đó, chủng PCMV2.TB.2019 nằm cùng nhánh phát sinh vói chùng FJ01 của Trung Quốc (MG696113). Như vậy các chủng PCMV nghiên cứu đều có nguồn gốc phát sinh với các chủng PCMV cùa Trung Quốc. 4. KẾT LUẬN Nghiên cứu đã xác định sự có mặt của PCMV trên lợn được nuôi tại 8 tinh phía bấc Việt Nam bàng kỳ thuật PCR với tì lệ nhiễm trung bình là 48,36%. Trình tự gen DPOL của 3 chủng virus PCMV thu thập được tại Hà Nội và Thái Bình có mức độ tương đồng cao về nucleotide và axit amin lần lượt đạt từ 99.22-100% và 99.17-100%. Kết quà dựng cây phát sinh loài cho thấy các chủng PCMV nghiên cứu nằm trong hai nhánh phát sinh khác nhau và có cùng nguồn gốc với các chùng PCMV từ Trung Quốc.